Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot9Q9JKY0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot9Q9JKY0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms