Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms