Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms