Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK24

Ppp2r3c, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r3cQ9JK24 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppp2r3cQ9JK24 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms