Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1Q9JIT0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms