Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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