Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm9sf3Q9ET30 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms