Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp29Q9ES63 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp29Q9ES63 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp29Q9ES63 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp29Q9ES63 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp29Q9ES63 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Usp29Q9ES63 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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