Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cse1lQ9ERK4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms