Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RhojQ9ER71 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms