Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms