Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlr6Q9EPW9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms