Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms