Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms