Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms