Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenooQ9DBC0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms