Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms