Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms