Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp12Q9D9M2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp12Q9D9M2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Usp12Q9D9M2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Usp12Q9D9M2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp12Q9D9M2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp12Q9D9M2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp12Q9D9M2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp12Q9D9M2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp12Q9D9M2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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