Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tmco5aQ9D9D5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tmco5aQ9D9D5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tmco5aQ9D9D5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tmco5aQ9D9D5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tmco5aQ9D9D5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmco5aQ9D9D5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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