Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TcimQ9D915 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TcimQ9D915 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms