Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ifi35Q9D8C4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ifi35Q9D8C4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ifi35Q9D8C4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ifi35Q9D8C4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ifi35Q9D8C4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ifi35Q9D8C4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ifi35Q9D8C4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ifi35Q9D8C4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ifi35Q9D8C4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ifi35Q9D8C4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ifi35Q9D8C4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms