Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms