Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms