Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cldn23Q9D7D7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cldn23Q9D7D7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cldn23Q9D7D7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn23Q9D7D7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn23Q9D7D7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn23Q9D7D7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn23Q9D7D7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn23Q9D7D7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Cldn23Q9D7D7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cldn23Q9D7D7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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