Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms