Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce1Q9D720 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms