Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc39Q9D5Y1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms