Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms