Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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PrameQ9D4Z5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PrameQ9D4Z5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PrameQ9D4Z5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms