Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms