Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms