Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms