Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pabpc6Q9D4E6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms