Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2lQ9D478 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms