Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.05■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4933428M09RikQ9D3X3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms