Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc71Q9D3W5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms