Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms