Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl53Q9D1H8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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