Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms