Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms