Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms