Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms