Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms