Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sgo1Q9CXH7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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