Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Utp23Q9CX11 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms