Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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