Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms