Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms