Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CWU4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms